La réforme du système de direction et de commandement est une mesure importante en réponse à l’appel à édifier une armée moderne, spécialisée, compétente au combat et sûre de vaincre à l’ère informatique. Elle vise à améliorer l’efficacité de l’armée en matière d’opérations et d’édification. Adhérant au principe selon lequel la Commission militaire centrale assure la direction exclusive, les zones de commandement se chargent des opérations interarmées et les différentes armées se focalisent sur la préparation de leurs unités, l’APL s’efforce de renforcer la direction centralisée et unifiée de la Commission militaire centrale et ses fonctions de commandement stratégique et de gestion stratégique. Cette réforme a permis de démanteler les systèmes établis depuis longtemps des départements généraux, des régions militaires et de la composition des forces avec une force terrestre dominante, et d’établir de nouveaux systèmes de direction, de gestion et de commandement opérationnel.
Les organes de la Commission militaire centrale ont été réorganisés pour remplacer les quatre départements généraux par quinze organes fonctionnels. Le système de direction et de gestion des services et des armes a été amélioré en créant un organe de commandement pour l’armée de terre, en fondant la Force de soutien stratégique et la Force de soutien logistique interarmées, et en rebaptisant le Second Corps d’artillerie Forces balistiques, afin de mettre en place un système de direction et de gestion « Commission militaire centrale – armées – troupes ».
Le système de direction et de commandement de la police armée a été réorganisé pour que le Comité central du PCC et la Commission militaire centrale exercent une direction centralisée et unifiée sur les troupes de la police armée, permettant la mise en place d’un système de direction et de commandement « Commission militaire centrale – police armée – troupes ».
Au niveau du système de commandement des opérations interarmées, l’APL a amélioré l’organe de commandement des opérations interarmées de la Commission militaire centrale, créé les organes de commandement des opérations interarmées au niveau des zones de commandement, et établi cinq zones de commandement, mettant ainsi en place un système de commandement des opérations « Commission militaire centrale – zone de commandement – troupes ».
Au niveau du système de surveillance judiciaire, la Commission militaire centrale a réorganisé sa Commission de contrôle de la discipline (ou Commission de supervision) ainsi que sa Commission politique et juridique, et elle a fondé un bureau d’audit, permettant la mise en place d’un système de fonctionnement du pouvoir au sein duquel la prise de décision, l’exécution et la supervision se contrôlent mutuellement et interagissent de façon coordonnée.
领导指挥体制改革
领导指挥体制改革是适应现代军队专业化分工和信息时代能打仗、打胜仗的要求，提高军队作战效能和建设效益的重大举措。按照“军委管总、战区主战、军种主建”原则，强化军委集中统一领导和战略指挥、战略管理功能，打破长期实行的总部体制、大军区体制、大陆军体制，构建新的军队领导管理和作战指挥体制。
调整组建新的军委机关部门，由过去的四总部调整为军委机关15个职能部门。完善军兵种领导管理体制，成立陆军领导机构，成立战略支援部队，第二炮兵更名为火箭军，成立联勤保障部队，构建起“中央军委—军种—部队”的领导管理体系。
调整武警部队领导指挥体制，中共中央和中央军委对武警部队实行集中统一领导，实行“中央军委—武警部队—部队”领导指挥体制。
建立健全联合作战指挥体制，健全军委联合作战指挥机构，组建战区联合作战指挥机构，成立5个战区，构建起“中央军委—战区—部队”的作战指挥体系。
建立健全法治监督体系，组建新的军委纪律检查委员会（军委监察委员会），组建新的军委政法委员会，组建军委审计署，形成决策权、执行权、监督权既相互制约又相互协调的权力运行体系。